Teilprojekt 3: Nicht-invasive Charakterisierung
Nicht-invasive Charakterisierung der zeitlichen und räumlichen Heterogenität von Sarkomen
TP3 zielt darauf ab, das Potenzial nicht-invasiver Technologien zur Erkennung und Überwachung von ITH zu nutzen. Durch die Anwendung von Flüssigbiopsie-Technologien (liquid biopsies) streben wir eine tiefgreifende zeitliche Auflösung der Überwachung von ITH an, die auf der Integration von seriell gewonnenen Methylom- und Transkriptomdaten aus vom Tumor stammenden zirkulierenden Nukleinsäuren mit entsprechenden Einzelzelldaten beruht, die im TP3 generiert werden. Als ergänzender Ansatz wird eine multimodale radiologische Bildgebung durchgeführt und mit räumlich aufgelösten histologischen und multimikrobiellen Daten in Zusammenarbeit mit dem TP 4 integriert.
Hauptziele:
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Integration von Einzelzelldaten aus Tumoren mit seriell gewonnenen Flüssigbiopsien zur longitudinalen ITH Analyse
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Verbesserung radiologischer ITH Erkennung durch multimodale metabolische und funktionelle Bildgebung
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Entwicklung von deep learning Modellen zur ITH Vorhersage durch Integration histologischer und radiologischer Daten